东直门医院创办于1958年，是国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”、国家“双一流”建设高校北京中医药大学第一临床医学院，是首批国家大型综合性三级甲等中医医院和国家示范中医医院，是首批国家中医临床研究基地和国家药物临床试验机构，是世界卫生组织中医适宜技术项目培训基地和国家级中医学实验教学示范中心，是首批国家医学中心(中医辅导类)和国家中医药传承创新中心。

面向新时代，医院创造性构建了“两区一部”战略布局，东城院区位于海运仓5号，通州院区位于翠屏西路116号，国际部位于东四北大街279号，形成了集传承人文传统、传导医学前沿、传播中华精粹于一体的蓬勃发展态势。